Skopjes Kale Fortress (Skopsko Kale) går tillbaka till 600-talet och ligger på den högsta punkten i staden med utsikt över Vardarfloden. Bara några steg från Gamla stan antas fästningen ha byggts under den bysantinska kejsarens regeringstid, med gul kalksten och travertin som kom från den romerska staden Skupi, som förstördes av en jordbävning. Kale-fästningen förstördes också delvis av en jordbävning 1963, och utgrävningsansträngningar har pågått i ungefär tio år och har hittills hittat träblåsinstrument och lerautsmyckningar från tusentals år, liksom grunden till 1200-talet kyrka och den största samlingen av bysantinska mynt som någonsin hittats i Makedonien.
Idag besöks fästningen ofta på vandringsturer i staden, och besökare kan gå längs de restaurerade fästningsmuren, som sträcker sig 120 meter (120 meter), eller klättra upp ett par torn som ger enastående utsikt runt Skopje. Ibland hålls teaterföreställningar på sommaren.