Medan de allra flesta besökare till sjön Petén Itza bor i Flores, med sitt stora utbud av hotell, restauranger och researrangörer, finns det andra alternativ. De små städerna El Remate, San José och San Miguel har alla grundläggande boende, mer autentisk atmosfär och tillgång till sina egna små ruiner, vandringsleder, grottor, spanskolor och andra avvikelser.
Observera att billiga offentliga båtar som en gång plockat sjön gradvis har fasats ut när vägar och bussförbättringar förbättras. Istället erbjuder operatörer gruppbåtturer, eller så kan du hyra en dyr privat cayuco. Budgetresenärer kanske vill hålla sig till kycklingbussar från Santa Elena-marknaden till destinationer runt sjön.