Den underbara manististiska Assisi-basilikan St. Mary of the Angels (Basilica di Santa Maria degli Angeli) byggdes på slätten nedanför Assisi och var över ett sekel under uppförandet mellan 1569 och 1679. Det beställdes av påven Pio V för att rymma tillströmningen av pilgrimer för att dyrka vid Cappella Porziuncola, eremitaget där St Francis bad i början av 1200-talet och grundade ordern av franciskanermunkar.
Santa Maria degli Angeli är designad av den perugianska arkitekten Galeazzo Alessi och är en av de största kristna kyrkorna i världen och mäter hela 126 meter (413,25 fot) och 65 meter (213,25 fot) bred. Den har ett barnlikt centralt skepp och sidogångar kantade med kapell; fresker av konstnären Andrea Appiani från 1700-talet pryder basilikans väggar. Den ursprungliga 1200-talets Cappella Porziuncola ligger direkt under
stor central kupol, nu skyddad från elementen för eftertiden. Cappella del Transito ligger i närheten och markerar den exakta platsen där Francis dog 1226; det visar helgonets enkla repbälte och ett terrakottaporträtt av Andrea della Robbia, utfört 1490. Båda kapellen är freskerade med scener som visar hans visioner.
Utanför basilikan finns Rosenträdgården, allt som finns kvar av skogarna i Monte Subasio som omringade Francis hermitage. Det intilliggande 1400-talet friary hus Porziuncola Museum, grundat av franciskanska munkar 1924 och uppvisar religiös konst och relikvarier från 1200- och 1300-talen.