Officiellt känd som katedralen i San Ildefonso, byggdes denna stora kyrka mellan 1561 och 1598, på platsen för ett mayatempel (och förolämpade skador genom att använda stenarna som en del av byggmaterialet.). Meridas katedral är den näst äldsta i Amerika efter Santo Domingo i Dominikanska republiken. Den designades och byggdes av samma arkitekt som konstruerade den ännu större i Mexico City.
Denna katedral har ett mycket annorlunda utseende än de flesta av de "chock- och vördnadsvärdiga" kyrkorna i Nya Spanien, eftersom den ransakades och rånades av sina skatter under den mexikanska revolutionen 1915. Detta gör den till en unik att besöka för sin extra elegans strukturell skönhet. Det domineras av stenkolonner, valv och krucifixet bakom alteret, en tjugofem fot lång björkträskulptur.